Udział w Nocy Muzeów jest dla Biblioteki Gdańskiej skutecznym sposobem na realizowanie wpisanych w jej misję celów dydaktycznych i popularyzatorskich. Interesujące tematy przewodnie, prezentacja bogatych zbiorów książnicy, jak również zaangażowanie organizatorek i uczestniczących pracowników przełożyły się na sukces dziewięciu edycji tego wydarzenia w latach 2011–2019. Ich tematami przewodnimi były kolejno: Noc z Janem Heweliuszem ze skarbca Biblioteki Gdańskiej, Moda na książkę – moda w książce, Groza w bibliotece, Świat biblioteki w jedną noc, Z książką za horyzont, Biblioteka ogrodem, Gedanum domus nostra – Gdańsk nasz dom, In mari vita tua – w morzu życie twoje, Geniusz – w 500 rocznicę śmierci Leonarda da Vinci. Podczas dotychczasowych Nocy Muzeów największe uznanie odwiedzających Bibliotekę budziły pokazy w Czytelni Zbiorów Historycznych. Prezentacje te to czasami jedyna okazja, aby z tak bliska obcować z cennymi rękopisami, starymi drukami, grafikami i innymi zbiorami specjalnymi, o których opowiadają kompetentni pracownicy. Stałymi atrakcjami Nocy Muzeów były ponadto ekspozycje nawiązujące do tematu wydarzenia w sali wystawowej i kiermasze publikacji bibliotecznych w holu historycznego budynku przy ul. Wałowej 15. Kolejne organizatorki przedsięwzięcia, również we współpracy z innymi trójmiejskimi instytucjami kulturalnymi, za każdym razem wzbogacały program o zajmujące prelekcje, warsztaty tematyczne, a nawet koncerty muzyczne. Bibliotekę Gdańską podczas Nocy Muzeów odwiedzało średnio około 670 osób, co świadczy o wartości tego narzędzia promocji książnicy.